Санкт-Петербургский Государственный Университет
Биологический Факультет

Кафедра Зоологии Беспозвоночных
 

Кариология и генетика инфузорий

Руководитель группы:
Раутиан Мария Сергеевна, mrautian@mail.ru, +7921–792–8487

В состав группы входят две тесно связанные подгруппы:

1. Коллекция живых культур инфузорий и их симбионтов (Culture Collection of Ciliates and their Symbionts, CCCS). В настоящее время коллекция размещена в РЦ «Культивирование Микроорганизмов».
Раутиан Мария Сергеевна, вед. научн. сотр. Лаб.Протистологии , руководитель коллекции, mrautian@mail.ru, +7921–792–8487
Лебедева Наталья Аркадьевна, ведущий специалист РЦ, куратор коллекции
Лиевина Татьяна Владимировна, ведущий специалист РЦ

2. Исследовательская группа
Раутиан Мария Сергеевна, вед. научн. сотр., mrautian@mail.ru, +7921–792–8487
Белявская Александра Ярославна, студент магистратуры (6 курс), лаборант
Фоменко Юлия Анатольевна, инженер, электронная микроскопия
Киселев Андрей Владимирович, студент (1 курс)

Список ключевых публикаций коллектива:

  1. Przybos E., Rautian M. New Stands of Species of the Paramecium aurelia Complex (Ciliophora, Protozoa) in the Mediterranean Region (Italy, Greece, Morocco). Folia Biologica (Krakow), vol. 60 (2012), No 3-4, p:147–149.
  2. EWA PRZYBOS , SEBASTIAN TARCZ , M AŁGORZATA PRAJER, MARTA SURMACZ , MARIA RAUTIAN, & NATALIA SAWKA Does high intraspecific variability o f two genome fragments indicate a recent speciation process o f Paramecium dodecaurelia ( P. aurelia species complex, Ciliophora , Protozoa)? //Systematics and Biodiversity (2012), 10(3): 289–304.
  3. Tarcz S, Potekhin A, Rautian M, Przybos E. Variation in ribosomal and mitochondrial DNA sequences demonstrates the existence of intraspecific groups in Paramecium multimicronucleatum (Ciliophora, Oligohymenophorea). Mol Phylogenet Evol. 2012; 63(2):500-509. Epub 2012 Feb 8.
  4. Przybos E, Tarcz S, Potekhin A, Rautian M, Prajer M. A two-locus molecular characterization of Paramecium calkinsi. Protist. 2012; 163(2):263–73. Epub 2011 Jul 27.
  5. Greczek-Stachura M., Potekhin A., Przybos E., Rautian M., Skoblo I., Tarcz S. Identification of Paramecium bursaria syngens through molecular markers — comparative analysis of three loci in the nuclear and mitochondrial DNA // Protist. 2012; 163(2):263–73. Epub 2011 Jul 27.
  6. Vakkerov-Kouzova, N.D., Rautian, M.S. Obtaining and characterization of "Holospora curviuscula" and Holospora obtusa, bacterial symbionts of the macronuclei of Paramecium bursaria and Paramecium caudatum //2011, Microbiology 80(5), pp. 728–732.
  7. Yashchenko Varvara, Gavrilova Olga, Rautian Maria, Jakobsen Kjetill. Association of Paramecium bursaria Chlorella viruses with Paramecium bursaria cells: ultrastructural studies. // European Journal of Protistology, 2011.
  8. Potekhin A., Przybos Ewa, Nekrasova Irina, Yashchenko Varvara, Rautian Maria Species of the Paramecium aurelia Complex in Russia: New Stands and Overall Distribution // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2010.  — Vol. 58,  — № 1-2.  — P. 73–78.
  9. Раутиан М. С. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА ИНФУЗОРИЙ// ГЕНЕТИКА, 2010.  — Vol. 46,  — № 9.  — P. 1192–1195.
  10. Nekrasova Irina V., Przybos Ewa, Rautian Maria S., Potekhin Alexey A. Electrophoretic Karyotype Polymorphism of Sibling Species of the Paramecium aurelia Complex // Journal of Eukaryotic Microbiology, 2010. — Vol. 57, — № 6. — P. 494–507.
  11. Vorobyev K.P., Andronov E.E., Rautian M., Skoblo I., Migunova A.V., Kvitko K.V. Detection of an atypical Paramecium bursaria chlorella symbiont // Protistology, 2009. — Vol. 6, — № 1. — P. 39–44.
  12. Przybos E., Tarcz S., Greczek-Stachura M., Surmacz M., Potekhin A., Rautian M. Molecular studies on intra-specific differentiation of Paramecium dodecaurelia, with description of new stands of the species (Protozoa, Ciliophora). // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2008. — Vol. 56, — № 3-4. — P. 249–262.
  13. Przybos E., Rautian M., Greczek-Stachura M., Potekhin A.. Polymorphism within Paramecium sexaurelia (Ciliophora, Oligohymenophorea) and description of a new stand of the species in China // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2007. — Vol. 55, — № 3–4. — P. 121–125.

Инфузории обладают уникальной генетической системой — они имеют в одной клетке ядра двух типов: макронуклеусы и микронуклеусы, различающиеся структурно и функционально. В последнее десятилетие достигнуты громадные успехи в понимании молекулярной структуры и дифференцировки этих ядер. Как сказывается специфика генетической системы инфузорий на структуре их биоразнообразия, видообразовании, расселении, возможности идентификации? Эти вопросы мы исследуем на модельной системе — инфузориях рода Paramecium. Важнейшей основой и результатом наших исследований является коллекция клонов, представляющих разные виды парамеций, собранные в различных географических, климатических, экологических районах Земного Шара.

Важной, по существу — самостоятельной — главой в изучении биоразнообразия парамеций является исследование их внутриклеточных симбионтов. Пионерские работы Д.В. Осипова по описанию и изучению внутриядерных бактерий рода Holospora были начаты в 70-е годы и продолжаются в нашей лаборатории. Они существенно расширились за счет привлечения молекулярных методов и вовлечения в работу новых видов симбионтов. В последние годы мы стали исследовать симбиоз хлорелл и P.bursaria.

Площадки, на которых работают научные группы:

Экспедиции
Тематика работы группы связана с изучением биоразнообразия парамеций и их симбионтов. Мы регулярно проводим экспедиции по сбору инфузорий. За последние 10 лет были проведены экспедиции, поддержанные грантами РФФИ, в различные регионы России: Астраханский заповедник, Псковскую и Тверскую области, Вологодскую область, Алтай, Верхнее Поволжье, Байкал и Бурятию, Камчатку. В 2013 году запланирована экспедиция в Якутию. Собранная нами коллекция CCCS будет размещена в РЦ «Культивирование микроорганизмов» — новом, создаваемом в СПбГУ центре, оснащенным современными установками и оборудованием, которые позволяют сохранять, расширять и интенсивно исследовать собранный материал.

Дружественные организации
Уникальная коллекция парамеций и их симбионтов является базой для исследования широкого круга вопросов: структура вида и видообразование у инфузорий, зоогеография и экология инфузорий, возможность идентификации организмов с помощью молекулярных маркеров (баркодинг), симбиотические отношения, эволюция и коэволюция партнеров по симбиозу, геномика симбионтов и многие другие. Разнообразие проблематики открывает возможности для научных контактов с различными российскими и зарубежными лабораториями. Наиболее активное сотрудничество сложилось с несколькими научными коллективами:

  1. Prof. E. Przyboś, PhD S. Tarcz, PhD M. Greczek-Stachura, Department of Experimental Zoology, Institute of Systematics and Evolution of Animals, Polish Academy of Sciences, Slawkowska 17, 31016 Kraków, Poland.
  2. Проф. М.С.Гельфанд. Институт проблем передачи информации РАН, Москва.
  3. Professor John Alverdy, Ph.D.RA (Professor) O. Zaborina. Section of General Surgery, Department of Surgery, Laboratory or Surgical Infection Research and Therapeutics.

наверх