Кариология и генетика инфузорий
Руководитель группы:
Раутиан Мария Сергеевна, mrautian@mail.ru, +7921–792–8487
В состав группы входят две тесно связанные подгруппы:
1. Коллекция живых культур инфузорий и их симбионтов (Culture Collection of Ciliates and their Symbionts, CCCS). В настоящее время коллекция размещена в РЦ «Культивирование Микроорганизмов».
Раутиан Мария Сергеевна, вед. научн. сотр. Лаб.Протистологии , руководитель коллекции, mrautian@mail.ru, +7921–792–8487
Лебедева Наталья Аркадьевна, ведущий специалист РЦ, куратор коллекции
Лиевина Татьяна Владимировна, ведущий специалист РЦ
2. Исследовательская группа
Раутиан Мария Сергеевна, вед. научн. сотр., mrautian@mail.ru, +7921–792–8487
Белявская Александра Ярославна, студент магистратуры (6 курс), лаборант
Фоменко Юлия Анатольевна, инженер, электронная микроскопия
Киселев Андрей Владимирович, студент (1 курс)
Список ключевых публикаций коллектива:
- Przybos E., Rautian M. New Stands of Species of the Paramecium aurelia Complex (Ciliophora, Protozoa) in the Mediterranean Region (Italy, Greece, Morocco). Folia Biologica (Krakow), vol. 60 (2012), No 3-4, p:147–149.
- EWA PRZYBOS , SEBASTIAN TARCZ , M AŁGORZATA PRAJER, MARTA SURMACZ , MARIA RAUTIAN, & NATALIA SAWKA Does high intraspecific variability o f two genome fragments indicate a recent speciation process o f Paramecium dodecaurelia ( P. aurelia species complex, Ciliophora , Protozoa)? //Systematics and Biodiversity (2012), 10(3): 289–304.
- Tarcz S, Potekhin A, Rautian M, Przybos E. Variation in ribosomal and mitochondrial DNA sequences demonstrates the existence of intraspecific groups in Paramecium multimicronucleatum (Ciliophora, Oligohymenophorea). Mol Phylogenet Evol. 2012; 63(2):500-509. Epub 2012 Feb 8.
- Przybos E, Tarcz S, Potekhin A, Rautian M, Prajer M. A two-locus molecular characterization of Paramecium calkinsi. Protist. 2012; 163(2):263–73. Epub 2011 Jul 27.
- Greczek-Stachura M., Potekhin A., Przybos E., Rautian M., Skoblo I., Tarcz S. Identification of Paramecium bursaria syngens through molecular markers — comparative analysis of three loci in the nuclear and mitochondrial DNA // Protist. 2012; 163(2):263–73. Epub 2011 Jul 27.
- Vakkerov-Kouzova, N.D., Rautian, M.S. Obtaining and characterization of "Holospora curviuscula" and Holospora obtusa, bacterial symbionts of the macronuclei of Paramecium bursaria and Paramecium caudatum //2011, Microbiology 80(5), pp. 728–732.
- Yashchenko Varvara, Gavrilova Olga, Rautian Maria, Jakobsen Kjetill. Association of Paramecium bursaria Chlorella viruses with Paramecium bursaria cells: ultrastructural studies. // European Journal of Protistology, 2011.
- Potekhin A., Przybos Ewa, Nekrasova Irina, Yashchenko Varvara, Rautian Maria Species of the Paramecium aurelia Complex in Russia: New Stands and Overall Distribution // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2010. — Vol. 58, — № 1-2. — P. 73–78.
- Раутиан М. С. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА ИНФУЗОРИЙ// ГЕНЕТИКА, 2010. — Vol. 46, — № 9. — P. 1192–1195.
- Nekrasova Irina V., Przybos Ewa, Rautian Maria S., Potekhin Alexey A. Electrophoretic Karyotype Polymorphism of Sibling Species of the Paramecium aurelia Complex // Journal of Eukaryotic Microbiology, 2010. — Vol. 57, — № 6. — P. 494–507.
- Vorobyev K.P., Andronov E.E., Rautian M., Skoblo I., Migunova A.V., Kvitko K.V. Detection of an atypical Paramecium bursaria chlorella symbiont // Protistology, 2009. — Vol. 6, — № 1. — P. 39–44.
- Przybos E., Tarcz S., Greczek-Stachura M., Surmacz M., Potekhin A., Rautian M. Molecular studies on intra-specific differentiation of Paramecium dodecaurelia, with description of new stands of the species (Protozoa, Ciliophora). // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2008. — Vol. 56, — № 3-4. — P. 249–262.
- Przybos E., Rautian M., Greczek-Stachura M., Potekhin A.. Polymorphism within Paramecium sexaurelia (Ciliophora, Oligohymenophorea) and description of a new stand of the species in China // FOLIA BIOLOGICA-KRAKOW, 2007. — Vol. 55, — № 3–4. — P. 121–125.
Инфузории обладают уникальной генетической системой — они имеют в одной клетке ядра двух типов: макронуклеусы и микронуклеусы, различающиеся структурно и функционально. В последнее десятилетие достигнуты громадные успехи в понимании молекулярной структуры и дифференцировки этих ядер. Как сказывается специфика генетической системы инфузорий на структуре их биоразнообразия, видообразовании, расселении, возможности идентификации? Эти вопросы мы исследуем на модельной системе — инфузориях рода Paramecium. Важнейшей основой и результатом наших исследований является коллекция клонов, представляющих разные виды парамеций, собранные в различных географических, климатических, экологических районах Земного Шара.
Важной, по существу — самостоятельной — главой в изучении биоразнообразия парамеций является исследование их внутриклеточных симбионтов. Пионерские работы Д.В. Осипова по описанию и изучению внутриядерных бактерий рода Holospora были начаты в 70-е годы и продолжаются в нашей лаборатории. Они существенно расширились за счет привлечения молекулярных методов и вовлечения в работу новых видов симбионтов. В последние годы мы стали исследовать симбиоз хлорелл и P.bursaria.
Площадки, на которых работают научные группы:
- РЦ «Культивирование Микроорганизмов». Корпус молекулярной генетики и молекулярной биологии, Петергоф.
- Лаб. Протистологии и экспериментальной зоологии. Корпус молекулярной генетики и молекулярной биологии, Петергоф.
Экспедиции
Тематика работы группы связана с изучением биоразнообразия парамеций и их симбионтов. Мы регулярно проводим экспедиции по сбору инфузорий. За последние 10 лет были проведены экспедиции, поддержанные грантами РФФИ, в различные регионы России: Астраханский заповедник, Псковскую и Тверскую области, Вологодскую область, Алтай, Верхнее Поволжье, Байкал и Бурятию, Камчатку. В 2013 году запланирована экспедиция в Якутию. Собранная нами коллекция CCCS будет размещена в РЦ «Культивирование микроорганизмов» — новом, создаваемом в СПбГУ центре, оснащенным современными установками и оборудованием, которые позволяют сохранять, расширять и интенсивно исследовать собранный материал.
Дружественные организации
Уникальная коллекция парамеций и их симбионтов является базой для исследования широкого круга вопросов: структура вида и видообразование у инфузорий, зоогеография и экология инфузорий, возможность идентификации организмов с помощью молекулярных маркеров (баркодинг), симбиотические отношения, эволюция и коэволюция партнеров по симбиозу, геномика симбионтов и многие другие. Разнообразие проблематики открывает возможности для научных контактов с различными российскими и зарубежными лабораториями.
Наиболее активное сотрудничество сложилось с несколькими научными коллективами:
- Prof. E. Przyboś, PhD S. Tarcz, PhD M. Greczek-Stachura, Department of Experimental Zoology, Institute of Systematics and Evolution of Animals, Polish Academy of Sciences, Slawkowska 17, 31016 Kraków, Poland.
- Проф. М.С.Гельфанд. Институт проблем передачи информации РАН, Москва.
- Professor John Alverdy, Ph.D.RA (Professor) O. Zaborina. Section of General Surgery, Department of Surgery, Laboratory or Surgical Infection Research and Therapeutics.
наверх